MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis H37Ra chromosome

Total Repeats: 109952

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_009525	CGAC	2	8	147789	147796	25 %	0 %	25 %	50 %	148659884
3502	NC_009525	TCG	2	6	147806	147811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659884
3503	NC_009525	GCA	2	6	147840	147845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659884
3504	NC_009525	GT	3	6	147900	147905	0 %	50 %	50 %	0 %	148659884
3505	NC_009525	GCT	2	6	147962	147967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659884
3506	NC_009525	TTGC	2	8	147979	147986	0 %	50 %	25 %	25 %	148659884
3507	NC_009525	TCG	2	6	148022	148027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659884
3508	NC_009525	CCG	3	9	148052	148060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659884
3509	NC_009525	CGT	2	6	148093	148098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659884
3510	NC_009525	CGT	2	6	148162	148167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659884
3511	NC_009525	CAC	2	6	148171	148176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148659884
3512	NC_009525	TGC	3	9	148323	148331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659884
3513	NC_009525	GAA	2	6	148348	148353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148659884
3514	NC_009525	TCG	2	6	148400	148405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659884
3515	NC_009525	CGC	2	6	148413	148418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659884
3516	NC_009525	GAT	2	6	148459	148464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148659884
3517	NC_009525	CG	3	6	148482	148487	0 %	0 %	50 %	50 %	148659884
3518	NC_009525	CCT	2	6	148488	148493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148659884
3519	NC_009525	TGA	2	6	148689	148694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148659884
3520	NC_009525	CG	3	6	148699	148704	0 %	0 %	50 %	50 %	148659884
3521	NC_009525	TCG	2	6	148751	148756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659884
3522	NC_009525	CGG	2	6	148794	148799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659884
3523	NC_009525	CGA	2	6	148851	148856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659884
3524	NC_009525	CGT	2	6	148872	148877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659884
3525	NC_009525	TCG	2	6	148931	148936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659884
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3531	NC_009525	C	6	6	149030	149035	0 %	0 %	0 %	100 %	148659884
3532	NC_009525	CCA	2	6	149043	149048	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148659884
3533	NC_009525	CGC	2	6	149064	149069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659884
3534	NC_009525	GCG	2	6	149090	149095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659884
3535	NC_009525	TCC	2	6	149136	149141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3536	NC_009525	GTG	2	6	149163	149168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_009525	CAG	2	6	149174	149179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3538	NC_009525	GTA	2	6	149183	149188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_009525	GCC	2	6	149208	149213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3540	NC_009525	GGGTC	2	10	149222	149231	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3541	NC_009525	AGT	2	6	149237	149242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_009525	CGT	2	6	149256	149261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3543	NC_009525	GC	3	6	149352	149357	0 %	0 %	50 %	50 %	148659885
3544	NC_009525	GCG	2	6	149370	149375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659885
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3553	NC_009525	GGT	2	6	149822	149827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_009525	GC	3	6	149837	149842	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3555	NC_009525	GCC	2	6	149868	149873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659886
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3573	NC_009525	GCT	2	6	150517	150522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659887
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3577	NC_009525	CTCGGT	2	12	150733	150744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3579	NC_009525	GGT	2	6	150859	150864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_009525	GCGG	2	8	150868	150875	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3581	NC_009525	GT	3	6	150885	150890	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_009525	TGG	2	6	150923	150928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659888
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3588	NC_009525	TCA	2	6	151107	151112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148659888
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3592	NC_009525	GCT	2	6	151215	151220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659888
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3595	NC_009525	GGC	2	6	151306	151311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659888
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3728	NC_009525	GAG	3	9	155574	155582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3862	NC_009525	GTC	2	6	161113	161118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659896
3863	NC_009525	GCACC	2	10	161166	161175	20 %	0 %	20 %	60 %	148659896
3864	NC_009525	ACCG	2	8	161197	161204	25 %	0 %	25 %	50 %	148659896
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3988	NC_009525	CGC	2	6	165880	165885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659900
3989	NC_009525	GATG	2	8	165915	165922	25 %	25 %	50 %	0 %	148659900
3990	NC_009525	TGC	2	6	165926	165931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659900
3991	NC_009525	TGC	2	6	165938	165943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659900
3992	NC_009525	ACC	2	6	165961	165966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148659900
3993	NC_009525	GAG	2	6	165995	166000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148659900
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3996	NC_009525	GCCGG	2	10	166140	166149	0 %	0 %	60 %	40 %	148659901
3997	NC_009525	CCGG	2	8	166225	166232	0 %	0 %	50 %	50 %	148659901
3998	NC_009525	CAC	2	6	166245	166250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148659901
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4000	NC_009525	AGA	2	6	166328	166333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148659901

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